Für ein US-Beschaffungsprogramm wurden 18 zivile Pilatus PC-12 in die USA ausgeführt, dort von Sierra Nevada für militärische Aufklärung umgerüstet und nach Afghanistan weitergegeben. Die Beschaffung gehörte zum US-Aufbauprogramm für die afghanischen Sicherheitskräfte. Der Special Mission Wing der afghanischen Streitkräfte nutzten den Typ ab 2015. SRF und Lighthouse Reports berichteten 2022 anhand von Flugdaten, Fotos und Dokumenten, dass bei Maschinen aus diesem Programm bereits in der Schweiz eine Öffnung im Rumpfboden für spätere Kameratechnik vorbereitet worden sei. Das SECO stufte die Schweizer Ausfuhren als zivile Standardflugzeuge ohne militärische Spezifikationen ein. Pilatus nahm zur Recherche keine Stellung. Lighthouse Reports ordnete einen dieser Aufklärer einem Luftangriff vom 15. Juli 2021 auf einen Markt im Bezirk Shahada, Badakhshan, zu. Pajhwok berichtete von 13 getöteten Taliban-Kämpfern und acht getöteten Zivilpersonen; SRF nannte zwölf zivile Todesopfer. Nach der Machtübernahme der Taliban im August 2021 dokumentierte RTS anhand von Bildern mindestens zwei PC-12 in ihrem Besitz. Die Besatzung des US-Aufklärungsflugzeugs U-28A mit dem Rufzeichen DRACO 42 unterstützte am 14. August 2018 einen Kampfeinsatz in Afghanistan und koordinierte Luftangriffe. Die U-28A basiert auf dem Schweizer Pilatus PC-12. Die US-Luftwaffe zeichnete die Besatzung im November 2019 für diesen Einsatz mit der Mackay Trophy aus.